种蛋选择种蛋必须来自确认健康无病的鸡群，种蛋在人孵前一定要经过严格挑选，因为种蛋质量好坏直接影响到孵化率的高低和雏鸡的质量，用新鲜优良的种蛋人孵可获得健状的雏鸡，具有相对较高的抵抗能力，能保证以后较好的生长发育，提高育雏率肺成率。陈旧、破损、裂纹、蛋形不正的种蛋，孵化出雏时间可能提前或延迟，孵出的雏鸡质量很差。有时这类种蛋由于受温度、湿度的影响，侵入蛋内的杂菌使鸡蛋蛋白质腐败分解，产生硫化氢、氨气等有害气体，污染孵化器及空气；还能引起好蛋爆裂，明显降低孵化率。选择种蛋必须注意：
(1)形状大小：种蛋应是标准的蛋圆形，一般横径4．3厘米左右，竖径5．5—6．0厘米，过长、太圆、两头尖的不能作种蛋用。种蛋大小因品种不同，重量上有一定差别，白壳蛋重量小，一般为50—61克；红壳蛋较大，蛋重是55—65克。太大的蛋往往是双黄蛋，不能做为种蛋。太小的蛋有的是无黄蛋，即使是正常蛋，其蛋内营养含量也较少，孵出鸡雏也弱小。因此，小蛋也不宜作为种蛋。在生产实践中，25周龄以前初产期鸡蛋不能作种蛋用。
(2)种蛋新鲜度：孵化用的种蛋应是新鲜种蛋，蛋壳颜色要符合品种要求。星杂288、海兰白等鸡种蛋必须是纯白壳，新罗曼、海兰褐、星杂579等鸡种蛋是红壳颜色，以色鲜、色深者为好。存放时间较久的种蛋，蛋壳色泽污暗、陈旧。用光照检查，新鲜种蛋气室较小，蛋黄居中；陈旧的蛋黄上漂，贴近蛋壳，而且气室较大，这是由于长久放置，蛋内水分蒸发的结果。
(3)蛋壳质量：蛋壳厚薄要适当，红壳蛋稍厚些，大约0．35—0．38毫米，白壳蛋薄些，0．33毫米左右。蛋壳太厚壳质致密，气孔少，孵化中期尿囊膜水分不易蒸发，雏鸡啄壳困难，胚胎容易死亡；蛋壳太薄则易碎。种蛋蛋壳不能有沙皮、裂纹。选择时一手抓两个种蛋，转动手指，轻轻碰撞，好蛋声音清脆，破蛋可听到破裂声。