种蛋管理是保证种蛋质量的重要环节，种蛋管理的好坏直接关系着孵化厂的经济效益。笔者从事蛋鸡孵化实际工作多年，现结合生产实际，谈谈种蛋管理的要点。
1、种蛋的运输
1.1夏季要注意防雨、防晒，冬季要保暖防寒。
1.2最好用蛋托和纸箱装蛋，避免种蛋相互碰撞。
1.3装运时一定要轻拿轻放，严防装蛋工具变形。
1.4运输过程中，车速应保持运行平稳，防止强烈震动而造成气室移位、蛋黄膜破裂和系带断裂等。
1.5种蛋运到目的地后，应尽快开箱检查，拣出破蛋，并清洁被污染过的蛋壳。
2、种蛋的选择
2.1种蛋的来源：种蛋必须选（购）自健康的种鸡群。
2.2蛋重大小：蛋重过小孵出的雏鸡体重小，而且出壳偏早，若没及时拣出容易发生脱水；蛋重过大则雏鸡出壳晚，腹部大，孵化率也低，蛋重在50～60克为宜。
2.3蛋的形状：正常应为卵圆形。蛋形过圆则不容易分辨气室所在部位，摆放也不稳，蛋形过长容易被碰破。
2.4蛋壳颜色：要符合本品种（系）的要求，色泽光亮，白壳蛋鸡所产颜色发灰的蛋说明种鸡的选育程度不高或不纯；褐壳蛋鸡产出色泽不一的蛋常是鸡群健康不良的表现。
2.5蛋壳清洁度：蛋壳应洁净，无污损痕迹．受粪便污染的蛋一般不宜用于孵化，若沉有少许污物则可经清洁消毒之后尽快入孵。
2.6蛋壳结构：要求致密均匀，厚度适宜，蛋壳表面光滑，壳上有皱纹、沙粒等异常蛋不宜用于孵化。
3、种蛋的贮存
3.1保存时间：当天产的种蛋最好不要入孵，保存期一般不超过7天，后期种蛋（50周龄以后）保存期最好不超过3天，笔者经多次测试，种蛋贮存超过3天后每多放一天，孵化时间延长25～35分钟，孵化率下降3%左右。
3.2蛋库温度：家禽发育的临界温度为23.9℃，超过临界温度，胚胎开始缓慢发育，温度低于0℃，种蛋易受冻，失去孵化能力，种蛋产下后应及时放入蛋库．贮存温度为12～18℃，以使胚胎发育完全停止。
3.3蛋库湿度：蛋库湿度应控在70%～80%范围内，湿度过低会导致种蛋水分蒸发。
3.4 生物防范：蛋库的环境保持清洁卫生，做到无鼠、无蚊和无蝇，尽量减少人员进出，并日定期消毒。
3.5蛋库通风：蛋库要求空气新鲜，通风良好，无有害气体和有刺激性气味。
3.6种蛋的摆放：存放1周左右，可将种蛋大头朝下排放在蛋托上，若保存期较长应定时翻蛋，或最好锐端向上放置，避免胚胎与壳膜相连。
3.7防止种蛋冒汗：种蛋贮存过程中，蛋壳表面会因空气中水分的凝结而破坏胶护膜，并使灰尘、微生物等粘附其上，污染和损及蛋的内容物。所以蛋库在保持温度适宜的同时，湿度应尽量稳定以防止种蛋胃汗。
4、种蛋的消毒
种蛋产出后，壳表面上附有许多微生物，随着细菌的迅速繁殖，将会侵入蛋内，影响孵化率和雏鸡的健康，同时也污染孵化器和用具，传播疾病，因此种蛋在每天收集后进行1次消毒，入孵前再消毒1次。
4.1熏蒸法：将种蛋放入密封的消毒室（柜）或孵化机内，按每立方米容积30毫升福尔马林和15克高锰酸钾，熏蒸消毒20分钟，熏蒸后打开机门或通气孔，让剩余气体排出。
4.2浸泡法：用0.2%的高锰酸钾溶液，加温40℃左右，浸泡种蛋1分钟、擦去壳上污物后取出装盘，晾干后待入孵。
4.3喷雾法：新洁尔火原液加水500倍，配成0.2%的溶液，用喷雾器喷洒蛋面。