剖检主要病变在盲肠，可见盲肠肿胀好几倍，呈棕红色或暗红色，质地比正常坚硬，剪开可见血凝块，或是含有一种黄色豆腐渣样、混有血液的坏死物质。若时间稍长者，盲肠中有一种凝血块、坏死物质、粘性渗出物凝固而成的栓子，堵塞肠腔。慢性病例病变多在小肠前中段，尤以十二指肠显著肿大。肠壁增厚发炎，剪开后肠粘膜上有小出血z区，内有粘性渗出物，常混有血块。
防治：对球虫病的预防，主要是加强管理，保持舍内干燥，定期清粪，并按综合防治措施的要求进行各种消毒。抗球虫的药物很多，应据具体情况选用，为防止球虫的耐药性的产生，应注意有计划地更换用药。常用的球虫药有青霉素、球痢灵、氯苯胍、三字球虫粉等。