每个养殖地区都有相应的免疫程序，是结合当地的疾病流行情况制定出来的，养殖户按表执行就能达到较高的保护率，但在实际操作中经常会出现下列情况。
由于疾病、时间安排等情况的影响，有时会出现两种或多种疫苗同时使用，导致两种疫苗使用间隔时间过短的情况。在养殖户看来，所有的免疫都做了就不会出现问题，而往往不注重免疫间隔。但事实上，疫苗之间受抗体排他性影响会发生竞争性干扰，加重机体的抗原反应，引起记忆应答紊乱，降低免疫效果。因此在做免疫时应考虑错开疫苗相互干扰的影响。
在养殖过程中，由于饲养管理等因素的影响，有的鸡场新城疫频发，养殖户就频繁不断地接种疫苗。间隔短到十天半月就做一次，他们认为疫苗做得越多保护率越高。实际上抗体效价有一定的消长规律，在短期内重复使用疫苗，除了有中和抗体的弊端外，频繁的抗原刺激，还会造成机体应答反应疲劳，形成免疫抑制，使家禽丧失对病原的抗御技能，引起发病。有的鸡场发病率低就人为减少了免疫次数，延长了免疫时间，造成免疫断档，致使抗体水平低于安全滴度而引发新城疫。要想免疫达到较好的效果就必须消除这些人为的因素，正确处理免疫次数和免疫间隔时间。